Se llama enfermedades infecciosas emergentes (EIE) a una clase de enfermedades infecciosas que surgen en lugares y momentos específicos y se convierten, o amenazan con convertirse, en nuevas epidemias. El concepto no se aplica sólo a enfermedades que afligen a las poblaciones humanas. El fenómeno está en el origen de buena parte de la legislación que restringe el tráfico de muestras o especímenes biológicos a través de las fronteras.
Se llama enfermedades infecciosas reemergentes a las grandes enfermedades infecciosas de antaño que siguen existiendo. Algunas azotan partes del planeta donde se creian erradicadas.
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